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真菌发生的与亲本菌株或标准菌株性状不一致的现象。包括表型变异、遗传结构变异和适应性变异。遗传结构变异是表型变异的基本原因，有的表型变异可由环境变化引起。
表型变异 真菌表现出的可观测到的各种形态、培养性状、生理生化反应及致病性等的变化。真菌形态和培养性状的变异常在实验室条件下发生，而生理生化反应和致病性的变异在自然界中也常发生。
形态变异 真菌的形态包括孢子大小、颜色、形态、产孢结构、菌丝组织体等营养体和繁殖体发生改变。真菌形态的变异，常使真菌鉴定和真菌分类命名工作产生混乱。
培养性状变异 表现为菌落生长速度的快慢、是否产生角变、色素产 ......
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